Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRPEL2-201ENST00000329271 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGA1-201ENST00000378105 4069 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF8-201ENST00000372977 6680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MROH7-206ENST00000421030 4329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTC1-201ENST00000290378 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK5-202ENST00000344720 3929 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EML1-202ENST00000327921 3715 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCAF1-201ENST00000355951 3343 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSMD2-204ENST00000373380 4379 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADSL-208ENST00000623063 4359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUSBP1-205ENST00000607545 4157 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 BARD1-211ENST00000613706 4153 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIM1-201ENST00000262901 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 HHAT-204ENST00000413764 3575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC80-202ENST00000439685 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPV5-201ENST00000265310 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX5-210ENST00000537393 2769 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRMPD1-203ENST00000539465 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 STXBP1-209ENST00000626539 3840 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRY-202ENST00000380250 10688 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRY-209ENST00000642040 10697 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCMH1-205ENST00000372595 3231 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRM8-203ENST00000358373 3850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RIMBP2-202ENST00000535703 3685 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHST4-201ENST00000338482 2412 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD22-201ENST00000085219 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PREPL-208ENST00000410081 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RP1-201ENST00000220676 7100 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCN5A-208ENST00000450102 6284 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTOG-203ENST00000399397 9948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ESR1-202ENST00000338799 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEG3-220ENST00000522771 6984 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFX2-201ENST00000303657 3993 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0040-203ENST00000545251 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO5A-205ENST00000399231 12225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNA1S-201ENST00000362061 6166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GFOD2-202ENST00000602279 5507 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGA5-202ENST00000611914 3552 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTR3C-206ENST00000613959 5142 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRIA1-202ENST00000340592 3170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMLR1-201ENST00000541421 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01498-201ENST00000502160 2984 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GUCY1A3-207ENST00000511108 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CALML3-AS1-202ENST00000543008 4531 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC120-207ENST00000606812 3857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AHCTF1-202ENST00000366508 8751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MUC21-201ENST00000376296 3651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPHA5-205ENST00000613740 8355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS6-219ENST00000622468 5453 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 KAT7-202ENST00000424009 3469 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 FMN1-201ENST00000320930 3930 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 GANAB-201ENST00000346178 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP000356.2-201ENST00000639904 4634 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 LY86-AS1-202ENST00000435641 2819 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EML4-202ENST00000401738 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087762.2-201ENST00000639346 3773 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPN20-201ENST00000374218 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms