Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDZRN4Q6ZMN7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms