Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2MP61081 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms