Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
KCNIP3Q9Y2W7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms