Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SRSF4Q08170 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms