Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AL359075.2-201ENST00000354921 4998 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SCRN1-201ENST00000242059 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRERF1-205ENST00000541110 7646 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GABRB3-204ENST00000541819 5934 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PART1-201ENST00000504876 5616 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MTSS1-205ENST00000518547 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CD96-202ENST00000352690 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3KBP1-203ENST00000379716 3819 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NCALD-203ENST00000395923 3808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNJ15-207ENST00000398934 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNA2-207ENST00000638532 2426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNJ1-202ENST00000382491 6958 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CHAF1B-201ENST00000314103 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PEX1-203ENST00000428214 3681 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO7B-201ENST00000409090 3567 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CSF3R-205ENST00000373106 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LAIR1-203ENST00000391742 4901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3GLB1-201ENST00000370558 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX9-201ENST00000361487 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SGSM1-202ENST00000400359 4317 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GRAMD1B-201ENST00000322282 2571 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TAF1-201ENST00000276072 5692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FBXL2-216ENST00000484457 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNA1E-205ENST00000367570 9724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PAX3-204ENST00000350526 3610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 VSIG4-204ENST00000455586 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092135.1-201ENST00000623398 2059 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 C19orf44-201ENST00000221671 3427 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC66-201ENST00000343457 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NFASC-206ENST00000404076 5728 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SAR1B-201ENST00000402673 6682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms