Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 BTN3A1-205ENST00000427334 570 ntTSL 43.3□□□□□ -1.883e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 SCART1-205ENST00000488261 4709 ntTSL 216.47■□□□□ 0.235e-9■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 SCART1-204ENST00000482993 4904 ntTSL 216.09■□□□□ 0.175e-9■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 SCART1-202ENST00000463137 4756 ntTSL 215.88■□□□□ 0.135e-9■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.255e-9■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 LINC-PINT-202ENST00000423414 616 ntTSL 417.62■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 LINC-PINT-204ENST00000431189 803 ntTSL 315.92■□□□□ 0.149e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 LINC-PINT-205ENST00000433079 1262 ntTSL 1 (best)14.88□□□□□ -0.039e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 LINC-PINT-203ENST00000429901 565 ntTSL 414.43□□□□□ -0.17e-10■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 LINC-PINT-208ENST00000451786 3505 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.769e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-208ENST00000582174 703 ntTSL 315.71■□□□□ 0.117e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 515.11■□□□□ 0.017e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 513.4□□□□□ -0.267e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-206ENST00000580805 2679 ntTSL 513.36□□□□□ -0.277e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.387e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-203ENST00000465427 746 ntTSL 59.17□□□□□ -0.947e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 59.13□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 FLOT2-205ENST00000580313 429 ntTSL 36.64□□□□□ -1.357e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MARK4-209ENST00000592762 683 ntTSL 518.99■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MARK4-205ENST00000588621 2024 ntTSL 217.31■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.013e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.363e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.483e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MARK4-207ENST00000590909 594 ntTSL 59.33□□□□□ -0.923e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MARK4-204ENST00000588533 625 ntTSL 26.93□□□□□ -1.33e-6■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.961e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 GRK6-208ENST00000511244 555 ntTSL 414.29□□□□□ -0.121e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 GRK6-204ENST00000502598 557 ntTSL 414.27□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 GRK6-205ENST00000506296 955 ntTSL 513.37□□□□□ -0.271e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 GRK6-209ENST00000512684 336 ntTSL 39.76□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.233e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.253e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 211.79□□□□□ -0.523e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-7■■■■□ 21.5
RBFOX2O43251 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.484e-10■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 ANKRD36C-204ENST00000528268 1907 ntTSL 27.41□□□□□ -1.224e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.824e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.411e-7■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 SHC2-205ENST00000590170 816 ntTSL 514.07□□□□□ -0.168e-7■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 PDLIM7-206ENST00000463411 1015 ntTSL 216.87■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 PDLIM7-204ENST00000393546 671 ntTSL 314.91□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 BMP4-208ENST00000559642 505 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-7■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 CUX1-218ENST00000560541 3176 ntTSL 59.39□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 SLC22A23-211ENST00000496753 561 ntTSL 48.75□□□□□ -1.015e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 AC008014.1-203ENST00000611243 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.164e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.84e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.31□□□□□ -0.69e-7■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.159e-7■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 SLC35E1-206ENST00000488894 1905 ntTSL 217.33■□□□□ 0.364e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.14e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 TSC22D4-205ENST00000493217 2060 ntTSL 1 (best)15.63■□□□□ 0.094e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 SLC35E1-203ENST00000436553 1343 ntTSL 315.58■□□□□ 0.084e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.064e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.254e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.814e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 PSAT1-202ENST00000376588 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.914e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 FGL1-201ENST00000381840 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.14e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 FGL1-205ENST00000427924 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.284e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 SLC35E1-201ENST00000409648 3691 ntTSL 26.6□□□□□ -1.354e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 FGL1-202ENST00000381841 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.44e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 FGL1-208ENST00000519055 640 ntTSL 56.19□□□□□ -1.424e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.474e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 FGL1-207ENST00000518769 318 ntTSL 34.2□□□□□ -1.744e-6■■■■□ 21.4
RBFOX2O43251 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.146e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.26e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NPRL3-213ENST00000621703 2812 ntTSL 1 (best)13.25□□□□□ -0.296e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NPRL3-214ENST00000622194 2981 ntTSL 513.16□□□□□ -0.36e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.496e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 NPRL3-208ENST00000473674 855 ntTSL 38.17□□□□□ -1.16e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.246e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CC2D1B-204ENST00000450942 2018 ntTSL 512.83□□□□□ -0.366e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CC2D1B-205ENST00000460261 2640 ntTSL 1 (best)11.44□□□□□ -0.586e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 CC2D1B-209ENST00000491136 4335 ntTSL 1 (best)8.79□□□□□ -16e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-210ENST00000590849 571 ntTSL 417.85■□□□□ 0.451e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-212ENST00000591059 594 ntTSL 417.71■□□□□ 0.431e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-212ENST00000477814 1784 ntTSL 216.72■□□□□ 0.275e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-204ENST00000429374 1634 ntTSL 1 (best)15.68■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-214ENST00000483222 2091 ntTSL 515.68■□□□□ 0.15e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-209ENST00000471375 928 ntTSL 515.11■□□□□ 0.016e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-221ENST00000498366 2153 ntTSL 515.02□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.045e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-207ENST00000470378 1034 ntTSL 314.74□□□□□ -0.054e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-218ENST00000496909 732 ntTSL 314.62□□□□□ -0.074e-8■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 MATK-207ENST00000590028 724 ntTSL 414.53□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-6■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-203ENST00000415993 2375 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.145e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-206ENST00000454936 1922 ntTSL 213.79□□□□□ -0.25e-7■■■■□ 21.3
RBFOX2O43251 HDAC10-211ENST00000476310 847 ntTSL 313.06□□□□□ -0.325e-8■■■■□ 21.3
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