Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CENPNQ96H22 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms