Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARHGAP1Q07960 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARHGAP1Q07960 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms