Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TNFSF18Q9UNG2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TNFSF18Q9UNG2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms