Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 FAT1-203ENST00000503253 462 ntTSL 21.11□□□□□ -2.232e-8■■■■■ 35.9
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PRPF8Q6P2Q9 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.874e-9■■■■■ 35.7
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PRPF8Q6P2Q9 MFN1-206ENST00000474903 1919 ntTSL 1 (best)2.48□□□□□ -2.014e-9■■■■■ 35.7
PRPF8Q6P2Q9 CUL3-207ENST00000451538 546 ntTSL 52.37□□□□□ -2.032e-6■■■■■ 35.7
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PRPF8Q6P2Q9 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 35.7
PRPF8Q6P2Q9 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 35.7
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PRPF8Q6P2Q9 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 35.7
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