Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KANK3Q6NY19 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KANK3Q6NY19 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms