Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
KANK3Q6NY19 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KANK3Q6NY19 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
KANK3Q6NY19 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
KANK3Q6NY19 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
KANK3Q6NY19 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
KANK3Q6NY19 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KANK3Q6NY19 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KANK3Q6NY19 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KANK3Q6NY19 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KANK3Q6NY19 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
KANK3Q6NY19 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KANK3Q6NY19 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KANK3Q6NY19 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KANK3Q6NY19 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KANK3Q6NY19 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KANK3Q6NY19 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
KANK3Q6NY19 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
KANK3Q6NY19 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KANK3Q6NY19 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KANK3Q6NY19 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KANK3Q6NY19 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
KANK3Q6NY19 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KANK3Q6NY19 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
KANK3Q6NY19 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
KANK3Q6NY19 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KANK3Q6NY19 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KANK3Q6NY19 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KANK3Q6NY19 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KANK3Q6NY19 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KANK3Q6NY19 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KANK3Q6NY19 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KANK3Q6NY19 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KANK3Q6NY19 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
KANK3Q6NY19 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
KANK3Q6NY19 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
KANK3Q6NY19 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KANK3Q6NY19 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KANK3Q6NY19 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KANK3Q6NY19 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KANK3Q6NY19 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KANK3Q6NY19 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KANK3Q6NY19 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KANK3Q6NY19 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KANK3Q6NY19 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
KANK3Q6NY19 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
KANK3Q6NY19 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KANK3Q6NY19 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KANK3Q6NY19 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KANK3Q6NY19 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KANK3Q6NY19 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KANK3Q6NY19 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KANK3Q6NY19 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KANK3Q6NY19 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KANK3Q6NY19 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
KANK3Q6NY19 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KANK3Q6NY19 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
KANK3Q6NY19 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KANK3Q6NY19 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KANK3Q6NY19 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
KANK3Q6NY19 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KANK3Q6NY19 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
KANK3Q6NY19 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
KANK3Q6NY19 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
KANK3Q6NY19 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
KANK3Q6NY19 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
KANK3Q6NY19 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
KANK3Q6NY19 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
KANK3Q6NY19 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
KANK3Q6NY19 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
KANK3Q6NY19 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
KANK3Q6NY19 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
KANK3Q6NY19 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KANK3Q6NY19 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KANK3Q6NY19 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KANK3Q6NY19 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KANK3Q6NY19 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KANK3Q6NY19 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KANK3Q6NY19 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KANK3Q6NY19 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KANK3Q6NY19 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KANK3Q6NY19 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KANK3Q6NY19 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KANK3Q6NY19 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
KANK3Q6NY19 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
KANK3Q6NY19 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KANK3Q6NY19 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KANK3Q6NY19 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
KANK3Q6NY19 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
KANK3Q6NY19 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
KANK3Q6NY19 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KANK3Q6NY19 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KANK3Q6NY19 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KANK3Q6NY19 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KANK3Q6NY19 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KANK3Q6NY19 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KANK3Q6NY19 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KANK3Q6NY19 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KANK3Q6NY19 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KANK3Q6NY19 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms