Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CTF1Q16619 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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