Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AFMP43652 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AFMP43652 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AFMP43652 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AFMP43652 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AFMP43652 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AFMP43652 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AFMP43652 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AFMP43652 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AFMP43652 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AFMP43652 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AFMP43652 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AFMP43652 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms