RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.06■■■■■ 5.6
PITX3-201ENST00000370002 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.65■■■■■ 4.74
PITX3-201ENST00000370002 ABCC9O60706 1549 aa44.11■■■■■ 4.65
PITX3-201ENST00000370002 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.31■■■■■ 4.36
PITX3-201ENST00000370002 NACADO15069 1562 aa42.2■■■■■ 4.35
PITX3-201ENST00000370002 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.97■■■■■ 4.31
PITX3-201ENST00000370002 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.92■■■■■ 4.3
PITX3-201ENST00000370002 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
PITX3-201ENST00000370002 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.51■■■■■ 4.24
PITX3-201ENST00000370002 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
PITX3-201ENST00000370002 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.05■■■■■ 4.16
PITX3-201ENST00000370002 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.99■■■■■ 4.15
PITX3-201ENST00000370002 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.97■■■■■ 4.15
PITX3-201ENST00000370002 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.75■■■■■ 4.11
PITX3-201ENST00000370002 SCRIBQ14160 1630 aa40.57■■■■■ 4.08
PITX3-201ENST00000370002 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
PITX3-201ENST00000370002 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.87■■■■□ 3.97
PITX3-201ENST00000370002 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.77■■■■□ 3.96
PITX3-201ENST00000370002 NCAPD3P42695 1498 aa39.01■■■■□ 3.84
PITX3-201ENST00000370002 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.87■■■■□ 3.81
PITX3-201ENST00000370002 SMARCA4P51532 1647 aa38.86■■■■□ 3.81
PITX3-201ENST00000370002 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
PITX3-201ENST00000370002 SMARCA2P51531 1590 aa38.82■■■■□ 3.8
PITX3-201ENST00000370002 HMGXB3Q12766 1538 aa38.69■■■■□ 3.78
PITX3-201ENST00000370002 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.61■■■■□ 3.77
PITX3-201ENST00000370002 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.5■■■■□ 3.75
PITX3-201ENST00000370002 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.49■■■■□ 3.75
PITX3-201ENST00000370002 ERCC6Q03468 1493 aa38.12■■■■□ 3.69
PITX3-201ENST00000370002 NESP48681 1621 aa38■■■■□ 3.67
PITX3-201ENST00000370002 CUX2O14529 1486 aa37.99■■■■□ 3.67
PITX3-201ENST00000370002 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.97■■■■□ 3.67
PITX3-201ENST00000370002 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.96■■■■□ 3.67
PITX3-201ENST00000370002 WIZO95785 1651 aa37.95■■■■□ 3.67
PITX3-201ENST00000370002 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.83■■■■□ 3.65
PITX3-201ENST00000370002 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.82■■■■□ 3.64
PITX3-201ENST00000370002 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.65■■■■□ 3.62
PITX3-201ENST00000370002 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
PITX3-201ENST00000370002 CFTRP13569 1480 aa37.49■■■■□ 3.59
PITX3-201ENST00000370002 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.43■■■■□ 3.58
PITX3-201ENST00000370002 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.43■■■■□ 3.58
PITX3-201ENST00000370002 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.36■■■■□ 3.57
PITX3-201ENST00000370002 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.3■■■■□ 3.56
PITX3-201ENST00000370002 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.3■■■■□ 3.56
PITX3-201ENST00000370002 WDR62O43379 1518 aa37.24■■■■□ 3.55
PITX3-201ENST00000370002 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.23■■■■□ 3.55
PITX3-201ENST00000370002 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
PITX3-201ENST00000370002 PRDM2Q13029 1718 aa36.87■■■■□ 3.49
PITX3-201ENST00000370002 ABCC8Q09428 1581 aa36.75■■■■□ 3.47
PITX3-201ENST00000370002 TOPBP1Q92547 1522 aa36.64■■■■□ 3.46
PITX3-201ENST00000370002 IFT140Q96RY7 1462 aa36.6■■■■□ 3.45
PITX3-201ENST00000370002 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
PITX3-201ENST00000370002 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.54■■■■□ 3.44
PITX3-201ENST00000370002 OSCARQ8IYS5 282 aa36.39■■■■□ 3.42
PITX3-201ENST00000370002 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
PITX3-201ENST00000370002 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
PITX3-201ENST00000370002 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
PITX3-201ENST00000370002 SOGA1O94964 1423 aa36.2■■■■□ 3.39
PITX3-201ENST00000370002 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
PITX3-201ENST00000370002 CUX1P39880 1505 aa36.13■■■■□ 3.38
PITX3-201ENST00000370002 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.13■■■■□ 3.37
PITX3-201ENST00000370002 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
PITX3-201ENST00000370002 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.09■■■■□ 3.37
PITX3-201ENST00000370002 WDR97A6NE52 1622 aa36.05■■■■□ 3.36
PITX3-201ENST00000370002 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
PITX3-201ENST00000370002 GRIN2BQ13224 1484 aa35.84■■■■□ 3.33
PITX3-201ENST00000370002 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.82■■■■□ 3.32
PITX3-201ENST00000370002 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.82■■■■□ 3.32
PITX3-201ENST00000370002 TRIM41Q8WV44 630 aa35.81■■■■□ 3.32
PITX3-201ENST00000370002 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
PITX3-201ENST00000370002 FBLN2P98095 1184 aa35.8■■■■□ 3.32
PITX3-201ENST00000370002 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.76■■■■□ 3.31
PITX3-201ENST00000370002 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.75■■■■□ 3.31
PITX3-201ENST00000370002 TOP2BQ02880 1626 aa35.72■■■■□ 3.31
PITX3-201ENST00000370002 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PITX3-201ENST00000370002 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.67■■■■□ 3.3
PITX3-201ENST00000370002 CHD1O14646 1710 aa35.67■■■■□ 3.3
PITX3-201ENST00000370002 SYNJ2O15056 1496 aa35.66■■■■□ 3.3
PITX3-201ENST00000370002 ARHGEF11O15085 1522 aa35.64■■■■□ 3.3
PITX3-201ENST00000370002 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
PITX3-201ENST00000370002 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
PITX3-201ENST00000370002 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.61■■■■□ 3.29
PITX3-201ENST00000370002 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.61■■■■□ 3.29
PITX3-201ENST00000370002 SYNJ1O43426 1573 aa35.6■■■■□ 3.29
PITX3-201ENST00000370002 PBRM1Q86U86 1689 aa35.48■■■■□ 3.27
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PITX3-201ENST00000370002 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.39■■■■□ 3.26
PITX3-201ENST00000370002 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.38■■■■□ 3.25
PITX3-201ENST00000370002 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.37■■■■□ 3.25
PITX3-201ENST00000370002 GRIN2AQ12879 1464 aa35.33■■■■□ 3.25
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PITX3-201ENST00000370002 CEP170Q5SW79 1584 aa35.09■■■■□ 3.21
PITX3-201ENST00000370002 IGF1RP08069 1367 aa35.08■■■■□ 3.21
PITX3-201ENST00000370002 SHROOM2Q13796 1616 aa34.94■■■■□ 3.18
PITX3-201ENST00000370002 JPH4Q96JJ6 628 aa34.92■■■■□ 3.18
PITX3-201ENST00000370002 CUL7Q14999 1698 aa34.88■■■■□ 3.17
PITX3-201ENST00000370002 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.84■■■■□ 3.17
PITX3-201ENST00000370002 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
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