Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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VAMP3Q15836 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
VAMP3Q15836 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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