Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
U3KQE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
U3KQE9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
U3KQE9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
U3KQE9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U3KQE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
U3KQE9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U3KQE9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
U3KQE9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
U3KQE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U3KQE9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
U3KQE9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U3KQE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
U3KQE9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
U3KQE9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U3KQE9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U3KQE9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
U3KQE9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U3KQE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
U3KQE9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
U3KQE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U3KQE9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U3KQE9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
U3KQE9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U3KQE9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
U3KQE9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
U3KQE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
U3KQE9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
U3KQE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U3KQE9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
U3KQE9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
U3KQE9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
U3KQE9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQE9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQE9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQE9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQE9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
U3KQE9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQE9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQE9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQE9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
U3KQE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQE9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQE9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQE9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
U3KQE9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
U3KQE9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQE9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQE9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQE9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
U3KQE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQE9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQE9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQE9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
U3KQE9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
U3KQE9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
U3KQE9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
U3KQE9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
U3KQE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
U3KQE9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQE9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQE9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
U3KQE9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQE9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQE9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQE9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQE9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
U3KQE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQE9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQE9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQE9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQE9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQE9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
U3KQE9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms