Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNX9Q9Y5X1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNX9Q9Y5X1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SNX9Q9Y5X1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SNX9Q9Y5X1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX9Q9Y5X1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms