Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SUPT16HQ9Y5B9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SUPT16HQ9Y5B9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SUPT16HQ9Y5B9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SUPT16HQ9Y5B9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SUPT16HQ9Y5B9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SUPT16HQ9Y5B9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
SUPT16HQ9Y5B9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SUPT16HQ9Y5B9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SUPT16HQ9Y5B9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SUPT16HQ9Y5B9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SUPT16HQ9Y5B9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SUPT16HQ9Y5B9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SUPT16HQ9Y5B9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms