Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KIF3AQ9Y496 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KIF3AQ9Y496 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
KIF3AQ9Y496 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
KIF3AQ9Y496 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KIF3AQ9Y496 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms