Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y478

PRKAB1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB1Q9Y478 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKAB1Q9Y478 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKAB1Q9Y478 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PRKAB1Q9Y478 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKAB1Q9Y478 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKAB1Q9Y478 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKAB1Q9Y478 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms