Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.54■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REXO2Q9Y3B8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
REXO2Q9Y3B8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
REXO2Q9Y3B8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
REXO2Q9Y3B8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
REXO2Q9Y3B8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms