Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L3Q9Y2J2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB41L3Q9Y2J2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EPB41L3Q9Y2J2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms