Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LIPT1Q9Y234 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIPT1Q9Y234 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIPT1Q9Y234 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms