Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW0

FOXJ3, Forkhead box protein J3, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ3Q9UPW0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXJ3Q9UPW0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXJ3Q9UPW0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXJ3Q9UPW0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOXJ3Q9UPW0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms