Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR5

PPT2, Lysosomal thioesterase PPT2, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT2Q9UMR5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPT2Q9UMR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPT2Q9UMR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPT2Q9UMR5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PPT2Q9UMR5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPT2Q9UMR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms