Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RNF112Q9ULX5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RNF112Q9ULX5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RNF112Q9ULX5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RNF112Q9ULX5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms