Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSFQ9UBX1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CTSFQ9UBX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CTSFQ9UBX1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CTSFQ9UBX1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CTSFQ9UBX1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms