Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M7

CGN, Cingulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNQ9P2M7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CGNQ9P2M7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CGNQ9P2M7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CGNQ9P2M7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CGNQ9P2M7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CGNQ9P2M7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CGNQ9P2M7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.6 ms