Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RCC2Q9P258 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RCC2Q9P258 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RCC2Q9P258 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RCC2Q9P258 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms