Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NKIRAS2Q9NYR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NKIRAS2Q9NYR9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NKIRAS2Q9NYR9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NKIRAS2Q9NYR9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 473.6 ms