Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
NKIRAS2Q9NYR9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NKIRAS2Q9NYR9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NKIRAS2Q9NYR9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKIRAS2Q9NYR9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKIRAS2Q9NYR9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NKIRAS2Q9NYR9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKIRAS2Q9NYR9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NKIRAS2Q9NYR9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NKIRAS2Q9NYR9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NKIRAS2Q9NYR9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKIRAS2Q9NYR9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NKIRAS2Q9NYR9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NKIRAS2Q9NYR9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NKIRAS2Q9NYR9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NKIRAS2Q9NYR9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKIRAS2Q9NYR9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NKIRAS2Q9NYR9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NKIRAS2Q9NYR9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NKIRAS2Q9NYR9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NKIRAS2Q9NYR9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKIRAS2Q9NYR9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKIRAS2Q9NYR9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKIRAS2Q9NYR9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKIRAS2Q9NYR9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NKIRAS2Q9NYR9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NKIRAS2Q9NYR9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKIRAS2Q9NYR9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKIRAS2Q9NYR9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKIRAS2Q9NYR9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKIRAS2Q9NYR9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKIRAS2Q9NYR9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKIRAS2Q9NYR9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKIRAS2Q9NYR9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKIRAS2Q9NYR9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKIRAS2Q9NYR9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NKIRAS2Q9NYR9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NKIRAS2Q9NYR9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NKIRAS2Q9NYR9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKIRAS2Q9NYR9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKIRAS2Q9NYR9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NKIRAS2Q9NYR9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKIRAS2Q9NYR9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKIRAS2Q9NYR9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKIRAS2Q9NYR9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKIRAS2Q9NYR9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKIRAS2Q9NYR9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKIRAS2Q9NYR9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKIRAS2Q9NYR9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKIRAS2Q9NYR9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKIRAS2Q9NYR9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKIRAS2Q9NYR9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKIRAS2Q9NYR9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKIRAS2Q9NYR9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKIRAS2Q9NYR9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKIRAS2Q9NYR9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NKIRAS2Q9NYR9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKIRAS2Q9NYR9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKIRAS2Q9NYR9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NKIRAS2Q9NYR9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKIRAS2Q9NYR9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NKIRAS2Q9NYR9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NKIRAS2Q9NYR9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NKIRAS2Q9NYR9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKIRAS2Q9NYR9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NKIRAS2Q9NYR9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS2Q9NYR9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NKIRAS2Q9NYR9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS2Q9NYR9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NKIRAS2Q9NYR9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NKIRAS2Q9NYR9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NKIRAS2Q9NYR9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NKIRAS2Q9NYR9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NKIRAS2Q9NYR9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS2Q9NYR9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NKIRAS2Q9NYR9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS2Q9NYR9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NKIRAS2Q9NYR9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKIRAS2Q9NYR9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NKIRAS2Q9NYR9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NKIRAS2Q9NYR9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NKIRAS2Q9NYR9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NKIRAS2Q9NYR9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NKIRAS2Q9NYR9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKIRAS2Q9NYR9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NKIRAS2Q9NYR9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms