Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERVK13-1Q9NX77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERVK13-1Q9NX77 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVK13-1Q9NX77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERVK13-1Q9NX77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms