Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRNAU1APQ9NX07 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRNAU1APQ9NX07 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRNAU1APQ9NX07 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRNAU1APQ9NX07 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRNAU1APQ9NX07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms