Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLN6Q9NWW5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLN6Q9NWW5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CLN6Q9NWW5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLN6Q9NWW5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLN6Q9NWW5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms