Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMBRD1Q9NUN5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMBRD1Q9NUN5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
LMBRD1Q9NUN5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LMBRD1Q9NUN5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LMBRD1Q9NUN5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LMBRD1Q9NUN5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LMBRD1Q9NUN5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms