Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUJ3

TCP11L1, T-complex protein 11-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1Q9NUJ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TCP11L1Q9NUJ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TCP11L1Q9NUJ3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TCP11L1Q9NUJ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TCP11L1Q9NUJ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCP11L1Q9NUJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TCP11L1Q9NUJ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.3 ms