Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD3

EXOSC4, Exosome complex component RRP41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC4Q9NPD3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EXOSC4Q9NPD3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EXOSC4Q9NPD3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXOSC4Q9NPD3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXOSC4Q9NPD3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms