Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAV7

GRPEL1, GrpE protein homolog 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRPEL1Q9HAV7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GRPEL1Q9HAV7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GRPEL1Q9HAV7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRPEL1Q9HAV7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRPEL1Q9HAV7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRPEL1Q9HAV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GRPEL1Q9HAV7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms