Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PIF1Q9H611 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PIF1Q9H611 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PIF1Q9H611 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIF1Q9H611 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms