Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NACA2Q9H009 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NACA2Q9H009 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NACA2Q9H009 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NACA2Q9H009 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NACA2Q9H009 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
NACA2Q9H009 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NACA2Q9H009 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NACA2Q9H009 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NACA2Q9H009 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.4 ms