Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRIM55Q9BYV6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM55Q9BYV6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM55Q9BYV6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM55Q9BYV6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms