Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KRTAP1-5Q9BYS1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRTAP1-5Q9BYS1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KRTAP1-5Q9BYS1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms