Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPL3Q9BY60 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GABARAPL3Q9BY60 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GABARAPL3Q9BY60 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GABARAPL3Q9BY60 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms