Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RSPO3Q9BXY4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RSPO3Q9BXY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RSPO3Q9BXY4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RSPO3Q9BXY4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms