Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCRT1Q9BWW7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCRT1Q9BWW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SCRT1Q9BWW7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SCRT1Q9BWW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms