Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SMIM2Q9BVW6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMIM2Q9BVW6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM2Q9BVW6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms