Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT92

TCHP, Trichoplein keratin filament-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHPQ9BT92 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TCHPQ9BT92 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TCHPQ9BT92 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCHPQ9BT92 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCHPQ9BT92 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCHPQ9BT92 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms