Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ROBO3Q96MS0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ROBO3Q96MS0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ROBO3Q96MS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ROBO3Q96MS0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ROBO3Q96MS0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ROBO3Q96MS0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms